La qualité des eaux souterraines est influencée par l'environnement géographique, la structure du sol, la composition des roches et les activités humaines. Par exemple, les eaux souterraines de certaines régions peuvent contenir de fortes concentrations de fer, de manganèse, de sulfure ou une dureté élevée, ce qui entraîne une eau jaune, des odeurs, de l'entartrage et d'autres problèmes.